
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱微生物 为其提供 TMT球蛋白组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
科研最终
深入分析职工实验设计跟着食品速冻用时拉长羊肉片的抗拉强度、持水力发电、汤色、徘徊铁含锌量、ROS、脂质过氧化的物、MDA、GSH和GPX4总体水平来监测肌肉组建组建组织的铁去世工作状态。结杲提示,食品速冻用时拉长后,羊肉片的抗拉强度在第8天和第6天有明显下跌;持水能力素质下降;顏色变深,丢失油润,鲜大桔红色调成暗大桔红色。再者,徘徊铁、活性氧氧和MDA的含锌量有明显曾加,组织凋亡率有明显变高。 深入探讨技术人员分离出来差情人冷冻箱时间段的腹肌检样的蛋清质,第三进行SDS-PAGE探讨,蛋清质条带在差情人时间段地理分布饱满且类似的(图1a)。只能根据蛋清在差情人检样中的表达出来情况发生,探讨看到相一致组检样的中四位数相近于相一致品质(图1b),证明腹肌检样蛋清质存在较好的组内类似的性和组间差情人性。 核核苷酸组学共签别出1996种核核苷酸。以B0为相较比较组,需求B1、B2、B4和B6中的核球核球蛋白酶来相互影响展现进行具体分析,共签别到37几个DEPs。将火山图数据可视化,并依照FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05二个规格进行具体分析DEP。报告右图1c-f所表示,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中分刘海别签别出22、33、73和140个DEPs,这其中分刘海别调整6、11、32和815个,调低16、22、41和52。聚类分析法的办法估评了异同食品冷藏的阶段背部胸肌组识中核核苷酸的展现,报告表示背部胸肌核球核球蛋白酶展现相互影响伴随着贮藏事件的加强而加强(图1g)。
图1| 有差异要在冷藏室保存事件的相关肌肉试样淀粉酶质组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 的差异食品冷藏准确时间的胸肌土样的差异球蛋白介绍(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁伤亡蛋清肽的PRM按量研究分析(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 立于KEGG生物富集文化差异形容球蛋白的铁去世制度化(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱个人总结
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱生物体提供了TMT降钙素原检测血清质组学技术设备性精准服务项目,拜谱生物学已研制开发达到并制定了落实成长期的转录组学、血清组学、分泌组学还有两组学联办产品设备技术设备性精准服务项目保障体系,欢迎致电咨询!
对比学术论文:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.