
近日,上海医科学校第一名付属卫生院王学浩中科院院士项目团队在Cancer Letters上发表了“O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma”的研究论文。该研究建立了一个涉及YBX1糖酵解和H3K18乳酸化的正反馈循环,从而加速了HCC的进展。破坏这种反馈循环可能为HCC提供一种新的治疗策略。拜谱生物为该研究提供了转录组测序,球蛋白互作组和靶向药物精力新陈代谢检测分析服务。
英语主题:O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma(Cancer Letters IF:10.1)
中文字幕题头:YBX1的O-乙酰葡糖胺化修饰驱动肝细胞癌中糖酵解-组蛋白乳酸化反馈环路
加盟商组织:南京医科大学
探索建筑材料:细胞
拜谱出示服务于:转录组测序+淀粉酶互作组+靶点能量消耗分解组
技术水平途径:
理论研究可是
01、YBX1被检测为HCC中糖酵解的关键所在遗传基因
本实验性收集HCC肺部淋巴肉瘤样品(n=7)的单生殖细胞系系RNA测序资料集实现分折,挖掘糖酵解活性酶类其主要聚集在肺部淋巴肉瘤生殖细胞系系中,hdWGCNA分折自动识别出9个基因组信息模块(图1A-G)。TCGA-LIHC链表的长期生活分折知道YBX1为独立性长期生活问题客观因素(图1H)。进第一步构建IHC、WB实验性和肺部淋巴肉瘤集体与临近非肺部淋巴肉瘤集体的三维空间转录组学资料集查证YBX1是肝生殖细胞系系癌手术治疗的内在的靶点(图1I-K)。
图1:YBX1被知道为调结HCC生殖细胞糖酵解的关健主观因素
02、YBX1促进会HCC中的有氧糖酵解和分裂繁殖
为了研究YBX1在调控HCC糖酵解中的作用。构建YBX1敲低细胞系,靶向疗法消耗的能量分解组学检测,敲低后糖酵解途径的几个关键中间体显著减少,三羧酸(TCA)循环中间体的水平也降低了(图2A-D);结合葡萄糖碳示踪法、细胞外酸化率检测等实验证实YBX1敲低后,糖酵解活性受损,葡萄糖摄取和乳酸分泌减少,抑制HCC细胞增殖(图2E-K)。
图2:YBX1力促HCC中的有氧糖酵解和分裂繁殖
03、OGT与YBX1根据并提高YBX1的O-GlcNAc糖基化
为了识别YBX1的调控因子,核蛋白互作组分析显示YBX1与O-GlcNAc转移酶(OGT)相互作用,并结合Co-IP和共定位进行验证(图3A–E)。进一步创建了一个OGT K908A突变体,利用O-GlcNAc糖基化激活剂、抑制剂OSMI-1判断YBX1的O-GlcNAc糖基化的变化(图3F-H),结构域分析OGT的TPR结构域对于与YBX1的结合至关重要(图3I-L)。免疫沉淀YBX1的质谱分析揭示了六个潜在的O-GlcNAc糖基化位点,并结合点突变和分析证实T57是YBX1上关键的O-GlcNAc糖基化位点(图3M-O)。
图3:OGT与YBX1搭配并力促YBX1的O-GlcNAc糖基化
04、YBX1的O-GlcNAc糖基化改善其磷酸性反应,进而有助于其核转位
进1步验测YBX1的O-GlcNAc糖基化可否印象其磷碱化,在OGT敲低的HCC内部中或用OGT仰药物OSMI-1工作,YBX1球蛋白质酶程度差异性下降,YBX1磷碱化差异性变少(图4A-C)。IP实践提示 ,在一样的Flag-YBX1底物程度下,YBX1-WT的磷碱化程度差异性不低于YBX1-T57A,表述磷碱化的增多不只仅是如果挺高的YBX1球蛋白质酶表达出出(图4D)。分离法了核和质酚类化合物遇到TMG工作的HCC内部中YBX1核表达出出的提升(图4E-F),进1步遇到YBX1磷碱化的重中之重缓解指数是AKT(图4G-I)。这么多遇到特别强调O-GlcNAc糖基化依据提高网站其磷碱化来加强YBX1球蛋白质酶稳固性并提高网站核转位。
图 4.YBX1的 O-GlcNAc 表达有助于于其进一次造成磷过酸表达并会推动其核转位
05、YBX1推动PKM2转录
前期结果表明YBX1 O-GlcNAc糖基化通过增强糖酵解和细胞增殖促进HCC进展。为了研究YBX1如何调控糖酵解,我们在HCC细胞中进行了转录组测序分析,糖酵解相关基因集在YBX1敲低细胞中显著抑制(图5A-B)。RNA 测序数据和 CUT&Tag 数据集以及ChIP-qPCR、QRT-PCR 分析表明PKM2 和 LDHA 是 YBX1 的直接转录靶标(图5C-H)。
图 5.YBX1提高PKM2转录
06、YBX1 都可以上升组球蛋白乳酸性反应体现的水平
测试找到YBX1敲低相关性削减球膳食纤维乳酸性反应,更是是H3K18乳酸性反应(图6A-C)。糖酵解缓和剂2-DG的测试断定了糖酵解与组球球蛋白乳酸性反应的简单关连,缓和糖酵解可相关性削减H3K18la程度(图6D)。PKM2过表示可逆反应转YBX1敲低引起的H3K18la降低,以外源乳酸整理这不仅加快H3K18la,还持续性YBX1表示调整,提示卡来源于正方向报告(图6E-G)。CUT&Tag与ChIP-PCR断定,H3K18la在聚集于YBX1开机子简单增加其转录,该操作过程受O-GlcNAc糖基化控制(图6H-J),并找到P300 调整是YBX1增加H3K18乳酰化做用的新机制(图6K-L)。
图6.YBX1加强H3K18乳碱化体现横向
小文章个人心得体会
在这样的科学研究中报到了YBX1在HCC中高表述出,如果与糖酵解迷切相应的。YBX1在T57处被O-GlcNAc突显,最后安全血清质并扩大其表述出。这样的突显还提高YBX1在T57处的磷过酸,提高其核易位。这样,该阶段增进了糖酵解相应的什么是染色体的转录并影响乳酸的有。不但,YBX1激发P300的转录,从根本上驱动下载组血清的乳过酸,特点是H3K18la,H3K18乳过酸朝政策调控YBX1什么是染色体转录(图7)。
图7.Y糖酵解-表观遗传性正负极馈环制度化图
拜谱个人总结
本研究结合了单细胞转录组、空间转录组的数据,利用转录组、蛋白互作组、代谢组以及多种分子实验揭示了一个YBX1-糖酵解-H3K18la 的反馈回路,驱动HCC进展,并提示针对HCC代谢的潜在治疗策略。拜谱生物制品为该研究提供了转录组测序,球蛋白互作组和靶向疗法动能细胞代谢组技术服务,拜谱微生物建立了完善成熟的转录组学、蛋白质组学、翻译工作后突显组学、消化吸收组学以及多组学联合产品技术服务体系,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!
选取学术论文
Ji Y, Xu Z, Tang L, Huang T, et,al.. O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma. Cancer Lett. 2025 Oct 28;631:217957. doi: 10.1016/j.canlet.2025.217957. Epub 2025 Jul 26. PMID: 40721081.