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首页 > 拜谱生物 > 干货分享 > 获得肺癌魅力:棕榈酸重程序编程提高结肠道癌进展情况

解锁癌症奥秘:棕榈酸重编程促进结直肠癌进展

发布时间:2024-08-26

癌症的代谢重编程一直是研究的焦点,然而,代谢如何影响癌症进展尚不清楚。棕榈酸是一种十六碳的饱和脂肪酸,作为脂肪的一个主要组成部分,棕榈酸可为机体提供能量,另一方面,棕榈酸可以参与肿瘤细胞信号传导途径,或者作为蛋白棕榈酰化的底物,影响多个细胞信号分子的功能。2023年3月7日,中山大学医学院附属第六医院兰平教授团队在Cell Discovery上在线发表了题为“Reprogramming of palmitic acid induced by dephosphorylation of ACOX1 promotes β-catenin palmitoylation to drive colorectal cancer progression”的文章,该研究发现代谢酶酰基辅酶 A 氧化酶 1 (ACOX1) 通过调节棕榈酸 (PA) 重编程来抑制结直肠癌 (CRC) 进展。ACOX1是一种肿瘤抑制因子,其下调会增加PA介导的β-catenin棕榈酰化和稳定性,并过度激活β-catenin信号传导,从而促进CRC进展。这一发现揭示了一个全新的治疗途径,即通过靶向β-catenin棕榈酰化,为未来的癌症治疗提供了宝贵的线索。

英文字母小标题:Reprogramming of palmitic acid induced by dephosphorylation of ACOX1 promotes β-catenin palmitoylation to drive colorectal cancer progression(Cell Discovery,IF=38.09,2023)

2英文子标题:ACOX1去磷酸化诱导的棕榈酸重编程促进β-catenin棕榈酰化,从而驱动结直肠癌进展

范例类形:临床癌和癌旁组织、HEK293T细胞

涉及到的组学工艺:定量蛋白组、S-棕榈酰化修饰组

一、最主要的研究方案然而

1.ACOX1 降低并与 CRC 进况相关的

为了能敲定在结人体直肠淋巴恶性肿瘤遭受中激发主要做用的产生涉及dna,编辑对基有所不同大动态数据集的起码1000个CRC中275两个产生涉及dna的转录横向对其做出了阐述,例如癌证dna组图谱(TCGA) CRC RNA-SeqV2、TCGA CRC RNA -Seq和dna把你想表达出来合理(GEO)。还有,还对基临床上上球氨基酸组淋巴恶性肿瘤阐述聯盟 (CPTAC) 大动态数据集和本探讨中的临床上上样表酶联免疫法质谱 (MS) 的起码100个CRC中的这部分产生涉及dna的球氨基酸横向对其做出了阐述。按照从叠阐述挑选了 CRC中明显改变了的 11 个产生涉及dna(图 1)。中应比喻,ACOX1是拥有的产生限速酶,被监定使用在事后阐述(图1)。

图1 ACOX1调整并与CRC重大进展有关于(图源:Zhang et al., Cell Discovery, 2023)

2. ACOX1短缺可维持 β-catenin并可以通过PA资料其转录活力性

要为找寻ACOX1上降低整的CRC关于内部无线电磁波牵张反射,在TCGA数据报告文件表中做了人类遗传基因集生物富集阐述 (GSEA)。GSEA 体现ACOX1与Wnt无线电磁波牵张反射负关于。与此同样,公共性数据报告文件表中ACOX1程度较低的恶性肿瘤进行和转入样本量中β-catenin靶人类遗传基因调整,这在内部实验性操作中到进一歩可确认。再者,在内部行动力测试实验性操作中出现了,ACOX1的过多描述促使了CRC内部的行动力,而β-catenin的过多描述就可以解救种情况发生,进一歩理论研究出现了ACOX1降低可利用PA比较稳定 β-catenin血清,为了增进其转录活性氧(图2)。

图2 ACOX1的缺位可维持β-catenin并能够 PA怎强转录催化活性(图源:Zhang et al., Cell Dis

3. PA介导的β-catenin棕榈酰化抑制性β-catenin的泛素化光降解

事先的钻研说明,PA是淀粉酶质棕榈酰化的底物,但会淀粉酶质棕榈酰化都能变更淀粉酶质-淀粉酶质相互之间能力。本钻研中,内源性β-catenin的棕榈酰化在HEK293T神经元中取到灵魂存在。PA 和棕榈酰化减缓剂2-溴棕榈酸酯 (2-BP)分离提升和减缓了β-catenin在466位半胱氨酸的棕榈酰化表达。2-BP棕榈酰化的减缓也消减了β-catenin的丰度,并驱动β-catenin多泛素化(图3)。许多数据分析说明,β-catenin淀粉酶的动态平衡性都能能够最新型棕榈酰化表达来的调节。

图3 PA介导的β-catenin棕榈酰化可压制β-catenin的泛素化(图源:Zhang et al., Cell

4. 人间结十二指肠癌中的DUSP14-ACOX1-PA-β-catenin轴失衡

关键在于肯定CRC中DUSP14、ACOX1 和β-catenin内的各种相应系数,编辑对人淀粉酶质图谱(HPA)动态数据密集的切换我们样版进行了诊疗样版的免疫抗体组织安排性物理,并检验了 ACOX1 和 DUSP14 内的负各种相应系数然后 ACOX1 和 β-catenin内的负各种相应系数。编辑会发现 DUSP14-ACOX1-β-catenin 轴在前面 CRC 中失调症。关键在于有效地检验一种观看最终结果,收藏了24个前面 CRC 样版 (T) 然后 领近的平常直肠组织安排性 (N)。这个CRC样版中 ACOX1 淀粉酶差异性减小,而 DUSP14 和 β-catenin 差异性添加(图 4)。还有,DUSP14与ACOX1、ACOX1与β-catenin内的负各种相应系数然后 β-catenin与DUSP14内的正各种相应系数也在CRC样版中获取进十步可确认(图4)。总而言之所讲,DUSP14-ACOX1-PA-β-catenin轴在CRC重大突破中起着至关决定性的功能,然后 Nu-7441能在治理和改善 DUSP14-ACOX1-PA称为手术治疗CRC 的因素管理策略。

图4 人体CRC中DUSP14-ACOX1-PA-β-catenin轴的功能紊乱(图源:Zhang et al., Cell

二、总结

排泄物能能调接血清质的当地翻译后掩盖,如PA能能掩盖血清质棕榈酰化,调接血清质模块。本探析出现 了了种新的β-catenin血清掩盖——棕榈酰化,相应棕榈酰化调接β-catenin安全稳明确的逻辑,这补充营养了大家对经典英文β-catenin血清讯号电荷转移的清楚。

三、拜谱个人心得体会

棕榈酸 (PA) 是一种ACOX1底物和高脂肪饮食中的主要脂肪酸,已被证明可以产生能量并调节参与癌症发展的细胞内信号分子。PA 可以在棕榈酰化过程中修饰半胱氨酸残基。越来越多的证据表明,蛋白质(如 PDL1、GULT1、STAT3 和 IFNGR1)的棕榈酰化会影响蛋白质功能和肿瘤进展。拜谱生物作为一家国内领先的多组学公司,在棕榈酰化修饰积累了丰富的项目经验,并已完成半胱氨酸修饰蛋白质组学产品的全面升级,助力Nature文章发表,现可提供棕榈酰化、亚硝基化、谷胱甘肽化、次磺酸性反应、硫巯基化、Total 腐蚀保存、悬浮巯基蛋白质组学拜谱生物,欢迎大家咨询!

基准文献:

Zhang Q, Yang X, Wu J, Ye S, Gong J, Cheng WM, Luo Z, Yu J, Liu Y, Zeng W, Liu C, Xiong Z, Chen Y, He Z, Lan P. Reprogramming of palmitic acid induced by dephosphorylation of ACOX1 promotes β-catenin palmitoylation to drive colorectal cancer progression. Cell Discov. 2023; 9(1):26. doi: 10.1038/s41421-022-00515-x.
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